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フーリエ変換赤外分光法を原理とするIRバイオタイパーにより作成したSalmonella属菌O抗原型別モデルの性能検証
https://doi.org/10.69203/iuhw291.042
https://doi.org/10.69203/iuhw291.042c90c54cb-58a6-4688-b64f-1152d0180e4d
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
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本文(PDF) (671.2 KB)
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| Item type | 学術雑誌論文 / Journal Article(1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 公開日 | 2025-01-21 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| タイトル | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| タイトル | フーリエ変換赤外分光法を原理とするIRバイオタイパーにより作成したSalmonella属菌O抗原型別モデルの性能検証 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| タイトル | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| タイトル | Verification of the performance of a Salmonella O antigen typing model generated by IR Biotyper based on Fourier transform infrared spectroscopy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | jpn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ | journal article | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題 | フーリエ変換赤外分析法 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題 | IRバイオタイパー | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題 | Salmonella属 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題 | O抗原型別 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題 | Fourier transform infrared spectroscopy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題 | IR Biotyper | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題 | Salmonella | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題 | O-antigen typing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ID登録 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ID登録 | 10.69203/iuhw291.042 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ID登録タイプ | JaLC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 著者 |
横山, 翼
× 横山, 翼
× 船島, 由美子
× 上田, 修
× 矢口, 貴博
× 川原, 健太郎
× 加藤, 匡平
× 若松, 謙太郎
× 宮本, 比呂志
× 永沢, 善三
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| 抄録 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 内容記述タイプ | Abstract | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 内容記述 | 目的：近年，フーリエ変換赤外分光法（FTIR）は，細菌のタイピングを実施する代替方法として注目されている．本研究ではFTIRを原理としたIR バイオタイパー（IRBT）にてSalmonella 属菌O抗原型別モデルを作成し，株タイピングの性能検証を行った． 方法：佐賀大学医学部病因病態科学講座微生物学分野および国際医療福祉大学福岡保健医療学部に保存され，O抗原およびH抗原の型別分類で血清型が特定された223株のSalmonella 属を対象に実施した． 結果：O抗原型別分類との一致率では，信頼性が最も高いGreenレベルは44.4％，次に信頼性が高いYellow レベルでは41.3％であった．精度は85.7％，エラー率は9.4％，分類失敗率は4.9％という結果であった． 結論：今回の学習モデルの精度では，IRBTは日常の細菌検査でのSalmonella 属のO抗原型別の予測解析は可能であるが，O抗原の確定方法としては難しいと思われる．しかし，株タイピングの新たなアプローチ方法の一つであり，今後検証が進むにつれ，新たな株タイピング法の一つとして確立していく可能性が示された． |
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| 言語 | ja | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 抄録 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 内容記述タイプ | Abstract | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 内容記述 | Purpose: Recently, Fourier transform infrared spectroscopy (FTIR), an alternative method for bacterial typing, has gained popularity. In this study, we created a Salmonella O antigen typing model using the IR Biotyper (IRBT) based on FTIR and verified its performance in strain typing. Methods: A total of 223 strains of Salmonella spp. were selected from the Department of Pathology & Microbiology, Faculty of Medicine, Saga University, and the Department of Medical Technology and Science, Faculty of Fukuoka Health Care, International University of Health and Welfare. These strains were then identified by O- and H-antigen typing. Results: The highest reliability of O-antigen typing was 44.4％at the green level, followed by 41.3％at the yellow level. The accuracy was 85.7％, the error rate was 9.4％, and the classification failure rate was 4.9％. Conclusion: Based on the accuracy of the present study model, IRBT can be used for predictive analysis of Salmonella O antigen typing in routine bacteriological examinations. However, using it as a method of O antigen determination is difficult. Nonetheless, IRBT is a new approach to strain typing and may be established as a new strain typing method as its validation progresses. |
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| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| bibliographic_information |
ja : 国際医療福祉大学学会誌 en : Journal of the International University of Health and Welfare 巻 29, 号 1, p. 42-48, 発行日 2024-03-31 |
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| 出版者 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 出版者 | 国際医療福祉大学学会 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| item_10001_source_id_9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | PISSN | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子 | 21863652 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 書誌レコードID（NCID） | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | NCID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子 | AA12537130 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 出版タイプ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 出版タイプ | VoR | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 出版タイプResource | http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
